Izoflavonoizii au o structură moleculară similară cu estrogenul steroidian (hormonul sexual feminin) și, prin urmare, sunt numiți și fitoestrogeni. Cu toate acestea, activitatea lor hormonală este mai mică cu un factor de 100 până la 1,000 în comparație cu estrogenul format în organismul mamiferelor. Datorită similitudinii lor chimico-structurale cu sexul feminin hormoni, izoflavone ingerat cu alimente se poate lega de așa-numitul receptor de estrogen de tip 2 și îl poate bloca pentru estrogenul endogen. În consecinţă, izoflavone la femeile aflate în postmenopauză, cu un nivel scăzut de estrogen endogen, prezintă un efect mai estrogenic, în timp ce izoflavonele la femeile aflate în premenopauză au un efect antiestrogen prin blocarea receptorilor de estrogen.
