Următoarele sunt cele mai importante boli sau complicații la care poate contribui boala Whipple:
Ochii și apendicele ochiului (H00-H59).
Sistemul cardiovascular (I00-I99)
- Endocardita (inflamație endocardică; a doua localizare cea mai frecventă).
- miocardita (inflamație a inimă muşchi).
- pericardită (inflamație a pericard) cu insuficiență valvulară.
Sistemul musculo-scheletic și țesut conjunctiv (M00-M99).
- poliartrită (inflamație multiplă articulații).
- Sinovialită (inflamație a membranei sinoviale)
Psyche - sistem nervos (F00-F99; G00-G99)
- Amnezie (pierdere de memorie)
- Ataxia (tulburări de mers)
- Priveste paralizia
- Demenţă
- Epilepsie (convulsii)
- Ritm deranjat de somn-veghe
Simptome și constatări anormale clinice și de laborator neclasificate în altă parte (R00-R99).
- Pleurezie (pleurezie).