Următoarele sunt cele mai importante boli sau complicații la care pot contribui encefalita japoneză:
Psihicul - Sistem nervos (F00-F99; G00-G99).
- Leziuni neurologice și / sau psihiatrice permanente, nespecificate - în mai mult de jumătate din cazuri.
Sarcină, nașterea și puerperiul (O00-O99).
- Avort (avort spontan)